奶奶与孙子可以做亲子鉴定，这属于隔代亲权鉴定。主要是通过检测线粒体 DNA 和 X 染色体 DNA 来判断亲缘关系。具体如下：

线粒体 DNA 检测：线粒体 DNA 是母系遗传，即母亲会将自己的线粒体 DNA 完整地传递给子女，儿子和女儿都有母亲的线粒体 DNA，但儿子的线粒体 DNA 不会再传递给下一代。虽然孙子的线粒体 DNA 来自其母亲，并非直接来自奶奶，但从母系遗传角度，可通过线粒体 DNA 检测判断奶奶与孙子是否存在母系血缘关系的可能性。

X 染色体 DNA 检测：奶奶有两条 X 染色体，孙子有一条 X 染色体，这条 X 染色体来自其母亲，而其母亲的 X 染色体中有一条可能来自奶奶。因此，可通过 X 染色体相关检测辅助判断奶奶与孙子的亲缘关系。

不过，由于奶奶和孙子之间的亲缘关系是二级亲缘关系，他们之间的基因差异相对较大，因此需要采集更多的 DNA 样本，进行更加的比对。而且这种隔代的鉴定只能在一定程度上确定亲缘关系的可能性，不能像父母子女鉴定那样准确地判断亲子关系