珍珠奶茶一般使用较大颗粒的粉圆，烹煮后的直径约在7毫米以上，否则直径太小时很容易满嘴珍珠，也不方便吞咽咀嚼。但大多数的珍珠奶茶商家仍有提供小颗粉圆的珍珠。当然也有一种“琥珀珍珠”这种珍珠是用100%的红糖来做的。
珍珠奶茶使用的“珍珠”，是由地瓜粉(南方说法，即淀粉)制作而成的粉圆，而粉圆在加入奶茶之前，通常还会先浸泡糖浆，确保粉圆在偏甜的奶茶中，仍可以保持甜味。奶茶的基底通常使用红茶，但也有店家提供使用绿茶的珍珠奶茶(称为珍珠绿奶或珍珠奶绿)。也有许多店家以咖啡冻、豆花、布丁、仙草、等类似口感的食物添加进奶茶里，让客人自由选择以增加口感。
等于5个便当的热量是有点太夸张了，不过呢依各家浓度、粉圆的数量不同，热量也不同一杯。360mL珍珠奶茶约有250到300大卡的热量，相当于一碗7、8分满的白饭，因此建议适量饮用。下面是相关报导：习惯没事来杯珍珠奶茶解馋的人要注意，除了担心防腐剂外营养师指出，奶精其实热量非常高只能偶尔喝一杯，就珍珠奶茶而言，除奶精是高油脂外，珍珠粉圆本身也属于具有热量的淀粉类，“往往一杯约300mL的珍奶热量相当于一碗白饭”，而且依各家浓度、粉圆的数量不同，热量也不同，更何况很多人点饮料时，往往要点一大杯珍奶，虽满足嚼劲但也吃进更多热量。
甜度：基本上以果糖为主，每家店的基本甜度都略有不同，且与制作的店员有关，若没有特别说明就是基本甜度。
全糖 / 十分糖：果糖量依各店家标准不同，放入标准的量。
半糖：果糖量只放该店家标准之一半。
少糖 / 微糖 / 三分糖：果糖量少于该店家标准之一半，多为三分糖（清心），或两分糖（微糖）。
无糖：不添加任何甜味，也有一些担心珍珠热量，或是只想喝珍珠甜味的顾客会选择无糖。
十二分糖：果糖量高于标准，由于部分店家冰块的使用量较大，有些顾客担心放久了不甜，因此会要求店家糖加多一点，此种说法是比较口语化的说法，等同于请店家糖加多一点之意，有点行家的点餐法之一。